まずは答えから
問題のセルを選択し、「データ」→「データの入力規則」を開きます。チェックボックスのルールがない場合は、編集可能な空のセルで「挿入」→「チェックボックス」を試してください。チェックのオン・オフはできても数式が誤った結果を返す場合は、チェックを入れたときにセルに入る値を確認してください。
関連資料Google
01表示されないセルを正常なチェックボックスと比べる
見出しへのリンク編集可能なエリアの空のセルを選択し、「挿入」→「チェックボックス」を選びます。クリックしてオン・オフを切り替えられることを確認してください。正常に動作する場合、そのセルのデータの入力規則を元のセルのルールと比較します。必要なルールを該当範囲に適用し直します。残したい値がある場合は、先にシートのコピーで試してください。
02チェックが切り替わらない場合は権限を確認する
見出しへのリンクボックスは見えているが変更できない場合は、編集可能であることがわかっている別の空白セルを編集してみてください。「閲覧者」や「閲覧者（コメント可）」はチェックボックスを切り替えることができません。ファイルの他の場所が編集できる場合は、オーナーまたは編集者に、そのチェックボックスが保護されたシートや範囲にあるか確認してください。
03数式が実際に読み取っている値を確認する
見出しへのリンク通常のチェックボックスは、チェックありの時にTRUE、なしの時にFALSEを使用します。カスタム値が設定されたチェックボックスは、代わりに「はい」や「いいえ」を保存している場合があります。入力規則の「カスタムのセル値を使用する」を確認してください。カウントやフィルターの結果が実際の表示と一致しない場合は、集計やフィルターで指定した値と実際にセルに入る値を比べます。そのうえでチェックを切り替え、結果を確認してください。